EMMSB Title

Minicursos

Período: 20 - 23 de Agosto de 2018

Horário Título Palestrante
14:30-16:00 Predição de Estruturas de Proteínas: Modelagem Comparativa e Ab initio
Local: Laboratório 4
Priscila Capriles Goliatt (UFJF), Manuela Leal da Silva (UFJF), Vinicius Carius de Souza (UFJF), Fábio Custódio (LNCC), Gregório Kappaun Rocha (LNCC) e Karina Baptista dos Santos (LNCC)
16:00-17:30 (turma 1)
17:30-19:00 (turma 2)
Simulações de Dinâmica Molecular
Local: Laboratório 4
Diego Enry Gomes (INMETRO e Univ. Strasbourg), Tacio Fernandes (UFRJ) e Pedro Pascutti (UFRJ)
14:30-16:00 (turma 1)
16:00-17:30 (turma 2)
Métodos de Docking Receptor-Ligante
Local: Laboratório 5
Isabella A. Guedes (LNCC) e Camila Magalhães (UFRJ)
17:30-19:00 Simulações de Monte Carlo - Programa DICE
Local: Laboratório 5
Kaline Coutinho (USP)
14:30-16:00 Métodos Quânticos QM/MM
Local: Laboratório 6
Gerd Bruno (UFPB) e Rafael Bernardi (Univ. Illinois at Urbana-Champaign)
16:00-17:30 Simulação de Proteínas de Biomembranas
Local: Laboratório 6
Hubert Stassen (UFRGS)
17:30-19:00 Simulações Coarse Grained com Campo de Força SIRAH
Local: Laboratório 6
Sergio F. Pantano (Institut Pasteur de Montevideo) e Matias Rodrigo M. Gonzales (Institut Pasteur de Montevideo)


Módulos Avançados*
Local: Auditório A (Limite de 180 vagas)
Horário Título Palestrante
16:00-17:30 Métodos de Aprendizagem de Máquina: Teoria e Prática Eduardo Krempser (FIOCRUZ)
17:30-19:00 Aspectos Práticos da Triagem Virtual em Larga Escala e Desenho Racional de Fármacos Isabella A. Guedes (LNCC) e Alessandro Nascimento (USP-SC)

*Para os cursos avançados os participantes deverão trazer seus próprios notebooks.



Palestras

Período: 20 - 24 de Agosto de 2018
Local: Auditório A (Limite de 180 vagas)

Segunda-feira - 20 de Agosto de 2018

(Introdução à Modelagem Molecular e Predição de Estruturas)

Horário Título Palestrante
08:00
19:00
Inscrições
09:00 Palestra de Abertura Munir Salomão Skaf (UNICAMP)
9:45 Campos de Força Clássicos e Dinâmica Molecular I Bruno Horta (UFRJ)
10:30
Coffee-break
10:30
Colocação dos Pôsteres (ímpares)
11:00 Simulações de Monte Carlo Kaline Coutinho (USP)
11:40 Técnicas de Aprendizagem de Máquina Eduardo Krempser (FIOCRUZ)
12:20 Introdução à Predição de Estrutura de Proteínas Fabio Custódio (LNCC)
13:00
Almoço
14:30
Minicursos



Terça-feira - 21 de Agosto de 2018

(Métodos Clássicos de Simulação Molecular)

Horário Título Palestrante
09:00 Campos de Força Clássicos e Dinâmica Molecular II Bruno Horta (UFRJ)
09:45 Estudo de Propriedades Estruturais, Dinâmicas e Termodinâmicas de Fluidos e Métodos Multiescala Luciano Tavares da Costa (UFF)
10:30
Coffee-break
10:45
Apresentação de Pôsteres Ímpares (confira aqui a lista)
11:40 Interação Simulação/Experimento Rafael Bernardi (Univ. Illinois/Urbana-Champaign)
12:20 A multiscale approach to the study of Flavivirus Sergio F. Pantano (Institut Pasteur de Montevideo)
13:00
Almoço
14:30
Minicursos


Quarta-feira - 22 de Agosto de 2018

(Planejamento Racional de Fármacos)

Horário Título Palestrante
09:00 Desenho Racional de Fármacos: Problemas, Desafios e Soluções Eliezer Jesus Barreiro (UFRJ)
09:45 Modelagem Molecular e Desenho Racional de Fármacos Claudio Norberto Cavasotto (IBioBA-MPSP)
10:30
Coffee-break
10:30
Colocação de Pôsteres (pares)
10:45 Docking Receptor-Ligante Laurent Emmanuel Dardenne (LNCC)
11:15 Funções Empíricas para Predição de Afinidade Receptor-Ligante Isabella Alvim Guedes (LNCC)
11:40 Cálculos de Energia Livre Ernesto Raul Caffarena (FIOCRUZ/RJ)
12:20 Estratégias Híbridas de Planejamento Racional Alessandro Nascimento (USP-SC))
13:00
Almoço
14:30
Minicursos


Quinta-feira - 23 de Agosto de 2018

(Métodos de Simulação Molecular I)

Horário Título Palestrante
09:00 Engenharia de Proteínas e Biomiméticos com Potencial em Diagnóstico e Vacinas Roberto Dias Lins (FIOCRUZ/PE)
09:45 Métodos Quânticos e Parametrizações Semi-Empíricas Gerd Bruno da Rocha (UFPB)
10:30
Coffee-break
10:45
Apresentação de Pôsteres Pares (confira aqui a lista)
11:40 Métodos Quânticos QM/MM em Simulaçõs de Dinâmica Molecular Rafael Bernardi (Univ. Illinois/Urbana-Champaign)
12:20 Simulações QM/MM com o Método de Monte Carlo Kaline Coutinho (USP)
13:00
Almoço
14:30
Minicursos


Sexta-feira - 24 de Agosto de 2018

(Métodos de Simulação Molecular II)

Horário Título Palestrante
09:00 Solvente Água Márcia Cristina Bernardes Barbosa (UFRGS)
09:45 Modelagem de Glicoproteínas Hugo Verli (UFRGS)
10:30
Coffee-break
10:45 Modelagem Estrutural de Complexos Grandes de Proteínas Utilizando Restrições de Crosslinks Paulo Ricardo Batista (FIOCRUZ/RJ)
11:30 Simulações Moleculares em Larga Escala Diego Enry Gomes (INMETRO e Univ. Strasbourg)
12:00 Estudos de coevolução em Proteínas e Predição de Contatos Lucas Bleicher (UFMG)
13:00
Almoço
14:30 Free energy profiles of a cythocrome P450 involved in lignin conversion Rodrigo Leandro Silveira
14:55 Free energy profile of peptidoglycan enzymatic cleavage Caroline Simões Pereira
15:20 Rational design and production of a scFv antagonistic to VLA-4 protein as a potential biopharmaceutical for chronic inflammatory diseases Beatriz Chaves
15:45 Ajuste de potenciais torcionais de aldohexopiranoses utilizando um algoritmo genético Felipe Castro Nepomuceno
16:10 Dinêmica molecular de dendrímeros PAMAM e PPI utilizando o campo de força GROMOS-compatible 2016H66: Análise sistemática dos efeitos de geração e pH Mayk Caldas Ramos
16:35 Development and validation of machine learning models for the identification of potential eye irritating compounds Steven Umuale Silva Hall
17:00 Molecular Basis of E6/E6AP/p53 on HPV-Mediated Oncogenesis Provides Insights into Inhibitory Strategies Madson Allan de Luna Aragão
17:25 Energetic landscape of the Bacillus polymyxa β glucosidase A and two thermostable mutants by metadynamics Pedro Henrique Camargo Fischer
18:00
Encerramento

*Os trabalhos selecionados para apresentação oral terão até 20 min de apresentação e 5 min de discussão.


Laboratório Nacional de Computação Científica - Avenida Getúlio Vargas, 333 - Quitandinha - Petrópolis - RJ
Tel: (24) 2233-6001 - Fax: (24) 2231-5595

Desenvolvido por Priscila Capriles